การสกัดด้วยคลื่นอัลตราโซนิกส่วนใหญ่ใช้ในอุตสาหกรรมน้ำผลไม้และเครื่องดื่มเพื่อสกัดส่วนผสมที่มีประสิทธิภาพ เช่น เพคตินและเม็ดสีจากพืชการสั่นสะเทือนอัลตราโซนิกสามารถทะลุผนังเซลล์พืช ทำให้เพกติน เม็ดสีพืช และส่วนประกอบอื่นๆ ไหลออกสู่น้ำผลไม้ในเวลาเดียวกัน อัลตราซาวนด์ยังคงทำงานเพื่อกระจายเพกตินและอนุภาคเม็ดสีพืชให้มีขนาดเล็กลงอนุภาคขนาดเล็กเหล่านี้สามารถกระจายลงในน้ำผลไม้ได้อย่างสม่ำเสมอและเสถียรยิ่งขึ้นความเสถียรของเพกตินที่สกัดด้วยอัลตราโซนิกและการกลั่นจะดีขึ้นอย่างเห็นได้ชัดการฉีดเข้าไปในน้ำผลไม้และเครื่องดื่มสามารถป้องกันไม่ให้ตกตะกอนและหลุดร่อนได้สีของเม็ดสีพืชที่สกัดและปรับปรุงด้วยอัลตราโซนิคจะสดใสยิ่งขึ้น ซึ่งสามารถปรับปรุงสีของน้ำผลไม้และเครื่องดื่มได้อย่างมาก